善と悪のロボット生命体の闘争を描く世界的人気シリーズの、日本を舞台としたオリジナルストーリー。正義の陣営ソードボットが、現代の少年たちと過去にタイムスリップ。侍チームと忍チームの2組の物語が別々に進行し、悪の軍団プレダコンと伝説のディスク争奪戦を繰り広げる。